舞台は、全てを呑み込み同化する暗黒の絶対虚無「デッドマター」によって
滅亡の危機に瀕した特別防衛国家「結倭ノ国（ゆわのくに）」。
プレイヤーは「媒人（なこうど）」として、化学元素の力を宿す10人の「志献官（しけんかん）」たちと共に、
世界消失まで残り50日というタイムリミットの中で、結合術を駆使して立ち向かう。